La Orquesta Filarmónica de Munich fue fundada en 1893. Mahler dirigió la orquesta en los estrenos mundiales de sus Sinfonías núms. 4 y 8, y en 1911 Bruno Walter dirigió el estreno mundial de La canción de la tierra. Ferdinand Löwe estableció la tradición bruckneriana de la orquesta, que fue perpetuada por Siegmund von Hausegger y Oswald von Kabasta.

Durante la época de Rudolf Kempe (1967-1976), realizó su primera gira a lo que entonces era la URSS. Los legendarios conciertos Bruckner, con su director titular Sergiu Celibidache, contribuyeron en gran medida a su reputación internacional. Zubin Mehta fue nombrado primer director honorífico de la orquesta. Con motivo del centenario del estreno de la Sinfonía núm. 8 de Mahler en Múnich, el entonces titular, Christian Thielemann dirigió dos interpretaciones de esta obra. Le sucedió como director titular Lorin Maazel, que ocupó el cargo hasta su muerte en 2014.

Valery Gergiev fue director titular de 2015-2022. Los programas más destacados incluyen ciclos de Shostakovich, Stravinski, Prokófiev y Rachmaninoff, así como nuevos formatos, como el festival "MPHIL 360°". En septiembre de 2016, se publicaron las primeras grabaciones bajo su propio sello, "MPHIL". El 13 de octubre 2018, celebraron su 125º aniversario interpretando la Sinfonía de los Salmos de Stravinski y la Octava sinfonía de Bruckner. En 2019, con Gergiev completaron el ciclo de las sinfonías de Bruckner en la basílica del Monasterio de San Florián, y las representaron en Bratislava, Nueva York, Viena, Ámsterdam, Baden-Baden, Colonia, Fráncfort, Hamburgo y Paris.

Ha desarrollado “Spielfeld Klassik” un amplísimo programa de educación musical. Unas 35.000 personas atienden los más de 150 eventos que llevan a cabo cada año. En 2021, inauguró la Isarphilharmonie, su nueva sede mientras duren las obras de renovación del Gasteig. La sala fue diseñada por los arquitectos Gerkan, Marg & Partner y la acústica por Yasuhisa Toyota y su empresa Nagata Acoustics.

En marzo 2022 Lahav Shani dirigió un concierto benéfico en apoyo a Ucrania con Anne-Sophie Mutter y las tres orquestas de la ciudad: Bayerisches Staatsorchester, Symphonieorchester des Bayerischen Rundfunks y Münchner Philharmoniker. En febrero 2023 Lahav Shani fue nombrado nuevo director titular de la orquesta a partir de septiembre 2026.

‍